IB-CAS  > 系统与进化植物学国家重点实验室
蔷薇科花楸属(Sorbus L.)分子系统学研究
Alternative TitleMolecular Phylogeny of Sorbus L.( Rosaceae)
王国勋
Subtype硕士
Thesis Advisor张明理
2011
Degree Grantor中国科学院植物研究所
Keyword花楸属 蔷薇科 系统发育 分子进化
Abstract花楸属(Sorbus L.)隶属于蔷薇科(Rosaceae)苹果亚科(Maloideae),主要分布于北温带地区,其中中国西南地区和高加索地区为两个重要的分化中心(Phipps et al.1990)。花楸属属内杂交和多倍化现象比较普遍, 分类处理一直存在争议, 该属是否为单系类群, 属下类群的系统发育关系也不清楚, 均需进一步验证,因此本研究的目的是搞清楚花楸属及其相关近缘类群的系统发育关系并对花楸属属下进行分子系统学研究。本文通过对46种花楸属的植物进行测序,并选取栒子属的2个种(Cotoneaster multiforus, Cotoneaster horizontalis)白鹃梅属(Exochorda racemosa),蔷薇属(Rosa hugonis)和樱属(Cerasus glandulosa)各一个种共5个种做为外类群,选择来自于核基因组(ITS)和叶绿体基因组(psbB-psbH, trnL-F, rbcL,)的4个DNA片段,基于最大简约分析(Maximum parsimony analysis简称MP),最大似然分析(Maximum likelihood analysis简称ML)和贝叶斯分析(Bayesian inference analysis简称BI)对花楸属进行分子系统发育重建。通过序列分析构建花楸属系统发育树,讨论了该属单系性以及属下类群的关系。主要结果如下: (1) 核基因DNA片段ITS序列分析 应用ITS序列对花楸属的46种及5个外类群进行分子系统发育重建。ITS矩阵序列长664bp,在235(35.9%)个变异位点中,有效变异位点即系统发育信息位点为136 (20.5%)。可以得出花楸属为单系类群(MP支持率bootstrap value (bt) = 100%,贝叶斯支持率posterior probability (pP) = 99%)。 (2) 叶绿体基因组DNA片段trnL-F , psbB-psbH和rbcL序列的联合分析 3个叶绿体基因片段的联合分析中,数据矩阵长3157bp,其中变异位点有338(10.7%),信息位点125(4.0%)。分析构建的系统发育树表明:花楸属为单系类群(MP支持率bootstrap value (bt) = 100%,贝叶斯支持率posterior probability (pP) = 99%)。 (3) 4个DNA片段的联合分析 4个DNA片段(ITS, psbB-psbH, trnL-F , rbcL)的联合数据矩阵长3797 bp,其中含变异位点为548(14.4%),信息位点为303(8.0%)。可以得出花楸属为单系类群(MP支持率bootstrap value (bt) = 100%,贝叶斯支持率posteriorprobability (pP) = 100%)。 根据得到的分子系统发育树,并结合前人的研究资料,我们认为花楸属为一单系类群,广义花楸属应包括复叶类群和单叶类群。
Pages29
Language中文
Document Type学位论文
Identifierhttp://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/11872
Collection系统与进化植物学国家重点实验室
Affiliation中国科学院植物研究所
First Author AffilicationInstitute Of Botany,The Chinese Academy Of Cciences
Recommended Citation
GB/T 7714
王国勋. 蔷薇科花楸属(Sorbus L.)分子系统学研究[D]. 中国科学院植物研究所,2011.
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