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棕色固氮菌突变株DJ35 中钼铁蛋白和HBP59 蛋白的研究—纯化特性及晶体生长
其他题名Purification, Characterization and Crystal Growth of MoFe Protein and HBP59 from a nifE-deletion strain DJ35 of Azotobacter vinelandii
边少敏
学位类型博士
导师黄巨富
2005
学位授予单位中国科学院植物研究所
学位专业植物学
关键词棕色固氮菌突变种DJ35 ΔnifE Av1和HBP59的纯化结晶 FeMoco和P-cluster 血红素
摘要我们从A. vinelandii突变株DJ35中纯化得到了ΔnifE Av1,并通过与OP Av1相比较对其特性进行了研究。虽然ΔnifE Av1以四聚体形式(α2β2)存在,但却表现出两种天然电泳行为。与OP Av1相比,ΔnifE Av1中的金属含量较低,每个蛋白分子仅含9.96个铁原子、0.36个钼原子。OP Av1和ΔnifE Av1的吸收光谱相似,均在280 nm附近出现蛋白吸收峰,在300-600 nm波长范围内光吸收普遍降低,并无特征峰出现。虽然ΔnifE Av1可见光区域CD谱的摩尔消光系数(Δε)总比OP Av1小,但在520nm区域附近摩尔消光系数减少的相对值明显大于在450nm附近摩尔消光系数减少的相对值。ΔnifE Av1的EPR信号明显与OP Av1不同,在g≈3.7处的EPR信号完全消失,在g≈4.3 和2.0处的EPR信号强度也分别降低了75%和50%以上。ΔnifE Av1不能与Fe蛋白组成活性单位,但被FeMoco激活后可与Fe蛋白组成活性单位。上述结果表明, ΔnifE Av1不含FeMoco,但具有与OP Av1相同的P-cluster。 我们在纯化ΔnifE Av1的过程中,发现一个类似OP Av1的β亚基的污染蛋白,经MALDI-TOF质谱鉴定这种蛋白是棕色固氮菌中一预测基因的产物。通过改进纯化方法, 我们首次得到80%电泳纯的蛋白,并将其命名为HBP59蛋白。HBP59为一单体蛋白,分子量约为59k Da。金属测定结果表明每个蛋白分子中含有0.42个铁原子。HBP59蛋白的可见光谱表现出典型的血红素蛋白光谱特征,还原态的HBP59蛋白在421nm处有最大吸收峰,同时在517nm、556nm处有两个伴随肩峰出现, A421/A280仅为0.146。HBP59蛋白氧化后,吸收峰发生蓝移,最大吸收峰从421nm移到413nm,517nm和556nm处的肩峰消失,A413/A280为0.168。HBP59蛋白的可见光区圆二色谱比较复杂,正峰出现在420nm, 406nm, 379nm 和364nm; 其摩尔消光系数分别为0.75, 0.94, 0.68 和 0.99;负峰出现在433 nm 和392nm,其摩尔消光系数分别为-1.13 和-0.78。血红素滴定实验结果说明每个HBP59蛋白分子结合了0.1个血红素,但每个蛋白分子具有最大结合1个血红素的能力。这低结合能力与这低比率的比率是非常一致的。该蛋白对温度相对敏感,高于40℃蛋白开始沉淀。上述结果说明HBP59是一个结合具有低自旋和不对称的血红素的蛋白,它在菌体内可能并未扮演贮藏血红素的角色,而是可能参与血红素的运输或附着。 此外,经过结晶条件的大量筛选后获得了ΔnifE Av1和ΔnifH Av1的优质小单晶,并对HBP59的晶体培养进行了初步探索。
页数83
语种中文
文献类型学位论文
条目标识符http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/14149
专题中科院植物分子生理学重点实验室
作者单位中国科学院植物研究所
第一作者单位中国科学院植物研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
边少敏. 棕色固氮菌突变株DJ35 中钼铁蛋白和HBP59 蛋白的研究—纯化特性及晶体生长[D]. 中国科学院植物研究所,2005.
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