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中药植物川牛膝基因组从头测序及分析 | |
闫燊; 池旭; 童凯; 李昭玲; 邓孟胜; 唐勇斌; 田孟良 | |
2016 | |
发表期刊 | 中国农业科技导报 |
ISSN | 1008-0864 |
卷号 | 18期号:03页码:32-37 |
摘要 | 川牛膝是我国重要大宗药材,但近年来品质退化严重,品种真伪混杂。为深入研究川牛膝有效成分积累的分子基础,采用第二代测序技术利用Illumina Hi-seq 2000测序平台对川牛膝进行全基因组测序,使用AByss进行初步组装,得到一个包含大量基因组序列信息的数据集,并对其进行重复序列及编码序列注释。在该测序结果基础上,初步预测得到川牛膝体内甾体合成途径,并对鉴定川牛膝真伪的SCAR分子标记进行了初步定位,为研究川牛膝主要有效成分杯苋甾酮的合成途径,改良川牛膝品质提供了基础。 |
关键词 | 川牛膝 从头测序 基因注释 杯苋甾酮 分子标记 |
DOI | 10.13304/j.nykjdb.2015.528 |
语种 | 中文 |
资助机构 | “十二五”国家科技支撑计划项目(2011BAI13B02-7)资助 |
引用统计 | |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/24922 |
专题 | 中科院植物分子生理学重点实验室 |
作者单位 | 1.四川农业大学农学院 2.中国科学院植物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 闫燊,池旭,童凯,等. 中药植物川牛膝基因组从头测序及分析[J]. 中国农业科技导报,2016,18(03):32-37. |
APA | 闫燊.,池旭.,童凯.,李昭玲.,邓孟胜.,...&田孟良.(2016).中药植物川牛膝基因组从头测序及分析.中国农业科技导报,18(03),32-37. |
MLA | 闫燊,et al."中药植物川牛膝基因组从头测序及分析".中国农业科技导报 18.03(2016):32-37. |
条目包含的文件 | ||||||
文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
中药植物川牛膝基因组从头测序及分析.pd(387KB) | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 浏览 请求全文 |
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