IB-CAS  > 植被与环境变化国家重点实验室
杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备
倪坚; 张艳华; 汤访评; 孙立夫; 裴克全; 薛煜
2014
发表期刊东北林业大学学报
ISSN1000-5382
卷号42期号:05页码:115-119
摘要454焦磷酸测序已成为真菌群落结构研究的常用手段,文中对454焦磷酸测序的Barcoded PCR扩增中的模板质量浓度、Mg2+和引物浓度等反应条件进行了优化,并对扩增所得产物的特异性进行了鉴定;同时就不同Taq酶对测序结果的影响进行了讨论。结果表明:DNA模板经适度稀释能显著提高反应效率;Mg2+及引物浓度对扩增反应效率有影响,建议上下游引物浓度均为0.1μmol·L-1,Mg2+浓度可不做调整;使用特异性好、活性较强的Taq酶对保证扩增产物的真菌特异性至关重要,建议选用热启动Taq酶。
关键词杜鹃花菌根真菌 454焦磷酸测序 样品制备 加接头的聚合链式反应 优化
DOI10.13759/j.cnki.dlxb.20140522.035
语种中文
资助机构国家自然科学基金项目(31170469)
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文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/26845
专题植被与环境变化国家重点实验室
作者单位1.绍兴文理学院
2.中国科学院植物研究所
3.东北林业大学
推荐引用方式
GB/T 7714
倪坚,张艳华,汤访评,等. 杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备[J]. 东北林业大学学报,2014,42(05):115-119.
APA 倪坚,张艳华,汤访评,孙立夫,裴克全,&薛煜.(2014).杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备.东北林业大学学报,42(05),115-119.
MLA 倪坚,et al."杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备".东北林业大学学报 42.05(2014):115-119.
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