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杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备 | |
倪坚; 张艳华; 汤访评; 孙立夫; 裴克全; 薛煜 | |
2014 | |
发表期刊 | 东北林业大学学报 |
ISSN | 1000-5382 |
卷号 | 42期号:05页码:115-119 |
摘要 | 454焦磷酸测序已成为真菌群落结构研究的常用手段,文中对454焦磷酸测序的Barcoded PCR扩增中的模板质量浓度、Mg2+和引物浓度等反应条件进行了优化,并对扩增所得产物的特异性进行了鉴定;同时就不同Taq酶对测序结果的影响进行了讨论。结果表明:DNA模板经适度稀释能显著提高反应效率;Mg2+及引物浓度对扩增反应效率有影响,建议上下游引物浓度均为0.1μmol·L-1,Mg2+浓度可不做调整;使用特异性好、活性较强的Taq酶对保证扩增产物的真菌特异性至关重要,建议选用热启动Taq酶。 |
关键词 | 杜鹃花菌根真菌 454焦磷酸测序 样品制备 加接头的聚合链式反应 优化 |
DOI | 10.13759/j.cnki.dlxb.20140522.035 |
语种 | 中文 |
资助机构 | 国家自然科学基金项目(31170469) |
引用统计 | |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/26845 |
专题 | 植被与环境变化国家重点实验室 |
作者单位 | 1.绍兴文理学院 2.中国科学院植物研究所 3.东北林业大学 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 倪坚,张艳华,汤访评,等. 杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备[J]. 东北林业大学学报,2014,42(05):115-119. |
APA | 倪坚,张艳华,汤访评,孙立夫,裴克全,&薛煜.(2014).杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备.东北林业大学学报,42(05),115-119. |
MLA | 倪坚,et al."杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备".东北林业大学学报 42.05(2014):115-119. |
条目包含的文件 | ||||||
文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 | ||
杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备(189KB) | 期刊论文 | 出版稿 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | 浏览 请求全文 |
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